制造与管理：负责研发、制造和管理各种刑具。锦衣卫诏狱中那些令人毛骨悚然的刑具，其技术开发和维护工作很大程度上由南镇抚司负责。
? 军械管理：管理锦衣卫的制式装备，如着名的“绣春刀”、弓弩、火器等武器的研制、储备和配发。
这使得南镇抚司还扮演了技术保障和研发部门的角色。
3. 与北镇抚司的关系：制衡与协作
明朝皇帝设立南北两个镇抚司，深谙权力制衡之道。
? 职能分离：北镇抚司专攻对外事务（监察百官、缉捕百姓、处理钦案），而南镇抚司专攻对内事务（监察锦衣卫内部）。这种分离有效地防止了权力过度集中在某一个部门或个人手中。
? 相互制衡：南镇抚司有权调查北镇抚司的人员，这在一定程度上对北镇抚司令人畏惧的权力形成了内部制约。理论上，如果北镇抚司的官员滥用职权，南镇抚司可以对其进行查处。
? 协作关系：在实际运作中，两个部门也需要协作。例如，南镇抚司研发的新刑具会提供给北镇抚司使用；在办理涉及锦衣卫人员与外部勾结的大案时，两者也会联合行动。
历史演变与形象
? 在明初，南镇抚司的权力和地位与北镇抚司相当。
? 到了明成化年间（1465-1487年），由于皇帝更加倚重北镇抚司处理重要案件，特许北镇抚司拥有直接向皇帝上奏的权力，北镇抚司的地位和权势从此急剧上升，远远超过了南镇抚司。
南镇抚司是锦衣卫体系中不可或缺的“内务”部门。它并非直面外界的尖刀，而是确保这把尖刀不会伤到自己、并且保持锋利的刀鞘和磨刀石。它的存在体现了明朝制度设计中内部监察和权力制衡的思想，虽然其后期地位被北镇抚司超越，但其在维持锦衣卫这个庞大特务机构正常运转方面起到了基础性的关键作用。
