中、大司马、都督中外诸军事、录尚书事，授予他黄钺（代表帝王权威的斧钺）。桓温任命抚军司马王坦之为长史。王坦之是王述的儿子。又任命征西掾郗超为参军，王珣为主簿，每件事都一定和这两人商议。桓温府中的人为此编了句话说：“胡子参军（郗超），矮子主簿（王珣），能叫公喜，能叫公怒。”桓温气概高远超逸，很少推崇别人。但他和郗超谈话后，常常自愧不能测其深浅，于是倾身结交，郗超也深深地自相结纳。王珣是王导的孙子，和谢玄都是桓温的属官，桓温都很看重他们。说：“谢掾（谢玄）四十岁时必定会持旌节统率一方，王掾（王珣）年纪轻轻就会做三公（黑头公），都是难得的人才。”谢玄是谢奕的儿子。
朝廷任命西中郎将袁真都督司、冀、并三州诸军事，北中郎将庾希都督青州诸军事。
癸卯（日期），前燕军队攻陷密城，刘远逃奔江陵。
秋季，八月：有彗星出现在角宿、亢宿区域。
前凉：张玄靓的祖母马氏去世，尊奉庶母郭氏为太妃。郭氏因为张天锡专擅朝政，与大臣张钦等人密谋诛杀他。事情泄露，张钦等人都被处死。张玄靓害怕，要把王位让给张天锡，张天锡不接受。右将军刘肃等人劝张天锡自立为王。
闰八月，张天锡派刘肃等人趁夜率兵入宫，弑杀了张玄靓，对外宣称他突然去世，谥号为冲公。张天锡自称使持节、大都督、大将军、凉州牧、西平公，当时十八岁。尊奉母亲刘美人为太妃。派遣司马纶骞捧着奏章前往建康请示朝廷任命，并送御史俞归返回东晋。
癸亥（日期），东晋大赦天下。
冬季，十月：前燕镇南将军慕容尘在长平攻打陈留太守袁披；东晋汝南太守朱斌乘虚袭击许昌，攻克了该城。
代国：代王拓跋什翼犍攻击高车（敕勒族），大败他们，俘获一万多人，牛、马、羊一百多万头。
东晋朝廷任命征虏将军桓冲为江州刺史。
十一月，姚襄的旧将张骏杀死了江州督护赵毐，率领他的部众向北反叛；桓冲讨伐并斩杀了他。
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【公元364年】
晋哀帝兴宁二年（甲子年，公元364年）
春季，正月：丙辰（日期），前燕大赦天下。
二月：前燕太傅慕容评、龙骧将军李洪攻掠黄河以南地区。
三月：庚戌朔（初一），东晋大规模清查户口，命令以现居地为准断定户籍（土断），严格执行法令，称为《庚戌制》（因在庚戌日颁布而得名）。
哀帝听信方士的话，断食五谷只服药以求长生。侍中高崧劝谏说：“这不是天子应该做的事；陛下这样做，简直像发生日食月食一样（过失明显）。”哀帝不听。辛未（二十二日），哀帝因药性发作，不能亲自处理万机（国家政务），褚太后再次临朝摄政。
夏季，四月：甲辰（二十五日），前燕李洪攻打许昌、汝南，在悬瓠击败东晋军队，颍川太守李福战死，汝南太守朱斌逃奔寿春，陈郡太守朱辅退守彭城。东晋大司马桓温派遣西中郎将袁真等人抵御燕军，桓温自己率领水军驻扎合肥。前燕军队于是攻取了许昌、汝南、陈郡，将一万多户百姓迁徙到幽州、冀州，派遣镇南将军慕容尘驻扎许昌。
五月：戊辰（二十日），东晋任命扬州刺史王述为尚书令。加授大司马桓温为扬州牧、录尚书事。壬申（二十四日），朝廷派侍中征召桓温入朝参与政事，桓温推辞不肯到来。
王述每次接受任命，都不虚情假意地辞让，凡是他推辞的就肯定不接受。等到他被任命为尚书令，儿子王坦之对他说：“按照旧例应当谦让一下。”王述说：“你认为我不能胜任吗？”王坦之说：“不是，但谦让一下自是美事！”王述说：“既然认为能够胜任，为什么又要辞让！别人都说你比我强，我看肯定不如我。”
六月：前秦王苻坚派大鸿胪授予张天锡大将军、凉州牧、西平公的官爵。
秋季，七月：丁卯（二十日），东晋朝廷下诏再次征召
