通镇的船只。
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与此同时，百代市的一栋别墅中，一位女性对着坐在椅子上的男人说道：“赤日大人，我们在钢铁岛上的计划，失败了。”
被称为赤日的男人说道：“原因？”
女人继续说道：“是因为几个年轻的训练家，还有一位波导的使者和火箭队。”
赤日微微叹气：“算了，不管他们，这件事不会影响我们的计划，还有什么事吗？”
岁星继续说道：“伙星被联盟抓起来了，您看？”
赤日说道：“把他赎回来吧，我们的计划还需要他。”
岁星点点头：“好的，我明白了。”然后离开了。
赤日微微一笑，逐渐消失在黑暗中。
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另一边，晴明和小智一行人终于踏上了前往木通镇的船只，波加曼与皮卡丘在船内愉快地玩耍着，它们跑来跑去，互相追逐，好不开心。然而，就在它们玩得正高兴的时候，突然有几个黑影从船外潜入了进来。这些黑影动作迅速，悄悄地靠近了波加曼和皮卡丘。
还没等波加曼和皮卡丘反应过来，它们就被这些黑影用一个大网给罩住了。原来，这些黑影正是火箭队三人组，他们一直想要抓住皮卡丘和波加曼，这次终于让他们得逞了。
火箭队带着皮卡丘和波加曼准备离开船只，就在这时，海况突然变得恶劣起来。海浪汹涌，船只剧烈摇晃，火箭队三人有些站立不稳。趁着这个混乱的时机，皮卡丘和波加曼拼命挣扎，终于从网中逃脱了出来。
它们在海浪中艰难地游动着，随着海浪的推动，最终漂流到了一座无人岛上。这座岛屿看上去十分荒凉，周围只有一些礁石和沙滩。
皮卡丘和波加曼在岛上四处探索，发现这里生活着许多朝北鼻和大朝北鼻。这些朝北鼻和大朝北鼻似乎对它们的到来并不感到惊讶，只是静静地看着它们。
在岛上的一处海滩边，皮卡丘和波加曼遇到了一只龙虾小兵。这只龙虾小兵正守护着一颗会发光的“宝石”，它对皮卡丘和波加曼充满了警惕。
经过一番交流，龙虾小兵告诉皮卡丘和波加曼，这颗“宝石”其实是一只在天上飞的宝可梦被雷电击中后落到岛上化成的。为了让这只宝可梦重新出现，龙虾小兵和一群小球飞鱼们一直在守护着这颗“宝石”。
