在之前的冒险中，小智、天桐和艾莉丝一路前行，经历了无数的挑战与冒险。他们与各种各样的宝可梦相遇，见证了宝可梦们的力量与羁绊。而星海作为一位独特的博士，带着她那强大且个性十足的宝可梦队伍，偶尔也会与小智一行人同行，分享彼此的冒险故事和奇妙经历。她的红色暴鲤龙、裂空座、喷火龙等宝可梦，每一只都有着惊人的实力，虽然星海不参与联盟赛事战斗，但她对宝可梦的研究和独特见解，让小智等人受益匪浅。
小智一行人在前往下一个城镇的途中，听闻了一个神秘遗迹的传说。据说遗迹中藏有强大的宝可梦力量，还有可能解开一些关于宝可梦历史的谜团。充满好奇心和冒险精神的小智立刻决定前往探寻，天桐和艾莉丝也欣然同意。
当他们来到遗迹附近时，意外遇到了星海。星海表示自己也听闻了这个遗迹的传说，作为宝可梦博士，她对这种可能蕴含着重要研究价值的地方自然不会错过。于是，众人决定一起进入遗迹。
遗迹内部阴暗潮湿，墙壁上刻满了奇怪的符号和宝可梦图案。小智和皮卡丘小心翼翼地走在前面，突然，地面开始剧烈震动，从墙壁中涌出了一群未知图腾。这些未知图腾散发着神秘的光芒，似乎在传达着某种信息。
星海立刻拿出她的研究设备，试图解读未知图腾的信息。经过一番努力，她发现这些未知图腾是在守护遗迹中的一个秘密，而这个秘密与一只强大的古代宝可梦有关。
此时，火箭队也得知了遗迹的消息，赶来想要抢夺宝物。他们派出了一群宝可梦，试图驱散未知图腾，闯入遗迹深处。小智见状，立刻派出了他的宝可梦迎战。
战斗一触即发，皮卡丘率先发动攻击，使用十万伏特电击火箭队的宝可梦。小次郎派出了双弹瓦斯，喷出毒雾试图干扰皮卡丘。天桐派出了花椰猴，利用草系技能吹散毒雾。艾莉丝则派出了牙牙，冲向双弹瓦斯发动猛烈的攻击。
星海也没有闲着，她派出了耿鬼。耿鬼使用影子球，精准地命中了火箭队的宝可梦，给他们造成了不小的伤害。在众人的齐心协力下，火箭队渐渐不敌，最终落荒而逃。
解决了火箭队后，众人继续深入遗迹。在遗迹的最深处，他们发现了一个巨大的宝可梦雕像，雕像上散发着神秘的能量波动。星海推测，这可能就是古代宝可梦的封印之处，但他们目前还无法解开这个封印。带着遗憾和对未来的期待，小智一行人离开了遗迹，继续他们的旅程。
小智等人来到了一个宁静的小镇，本想在这里稍作休息，补充物资。然而，小镇却突然遭遇了危机。一群野生的大狼犬不知为何变得异常狂暴，在小镇中横冲直撞，咬伤了不少居民和宝可梦。
小镇的居民们惊慌失措，纷纷向小智等人求助。小智毫不犹豫地站了出来，表示一定会帮助大家解决这个问题。星海也表示会提供协助，她仔细观察着大狼犬的行为，试图找出它们狂暴的原因。
经过一番调查，星海发现这些大狼犬是受到了一种神秘能量的影响，这种能量似乎来自小镇附近的一个山洞。小智决定带领大家前往山洞一探究竟。
在山洞中，他们发现了一个散发着诡异光芒的水晶。原来，这个水晶是火箭队为了制造强大的宝可梦武器而放置在这里的，没想到却引发了意外，影响了周围的宝可梦。
小智和他的宝可梦们立刻与火箭队展开了战斗。火箭队派出了阿柏怪和双弹瓦斯，企图阻止小智等人破坏水晶。皮卡丘再次发挥出强大的实力，用十万伏特将阿柏怪和双弹瓦斯打得节节败退。
星海派出了路卡利欧，路卡利欧使用波导弹，精准地击中了火箭队的宝可梦，让他们陷入了困境。在激烈的战斗中，小智发现了水晶的弱点，他指挥喷火龙使用火焰喷射，集中力量攻击水晶的弱点。
在喷火龙强大的火焰攻击下，水晶终于被摧毁，神秘能量也随之消失。大狼犬们恢复了正常，小镇也恢复了往日的宁静。居民们对小智等人感激不已，在小镇居民的热
