龙的背部，对着小智一行人喊道：“大家快上来，暴鲤龙会保护我们安全到达深海！”
小智、哈普乌和默丹依次跳上暴鲤龙的背部，莉莉艾、玛奥、水莲和卡奇则乘坐着水莲的西狮海壬，跟在后面。红色暴鲤龙摆动着巨大的尾鳍，乘风破浪，向着波尼湾的深海区域疾驰而去。
红色暴鲤龙的速度极快，穿梭在湛蓝的海水中，周围的热带鱼群纷纷避让。星海稳稳地站在暴鲤龙的背上，手中的检测仪不断刷新着数据，指引着前进的方向。“还有三公里就到了，”星海大声说道，“大家注意，前方的水流开始变得紊乱，可能是装置造成的影响。”
话音刚落，一股强大的水流突然从下方袭来，红色暴鲤龙迅速摆动尾鳍，避开了冲击。“是髅队的宝可梦！”默丹的目光锐利，率先发现了隐藏在礁石后的敌人——三只戴着潜水装置的髅队成员，身边跟着巨牙鲨、毒刺水母和刺甲贝。
“碍事的家伙！”其中一名髅队成员冷笑一声，“巨牙鲨，使用咬碎！毒刺水母，放电！刺甲贝，冰锥！”
巨牙鲨张开血盆大口，向着红色暴鲤龙猛冲过来；毒刺水母的触手释放出蓝色的电流，在海水中扩散开来；刺甲贝则喷出无数锋利的冰锥，密密麻麻地向着众人袭来。
“暴鲤龙，使用水炮反击！”星海冷静地下达指令。红色暴鲤龙猛地张开嘴，喷出一道巨大的水柱，直接冲散了毒刺水母的电流，同时将大部分冰锥击碎。巨牙鲨的咬碎落空，被水炮的冲击力震得后退了好几米。
小智立刻抛出精灵球：“皮卡丘，十万伏特！”皮卡丘纵身跳起，对着毒刺水母释放出强大的电流，毒刺水母在海水中受到的电击伤害加倍，发出痛苦的呻吟，身体失去了平衡。
“重泥挽马，使用地震！”哈普乌也发起了攻击。重泥挽马重重地跺了一下脚，强大的地震波通过海水传递出去，礁石剧烈摇晃，刺甲贝的外壳出现了裂纹，巨牙鲨也被震得晕头转向。
默丹则取出了自己的精灵球：“阿勃梭鲁，使用恶之波动！”一只通体白色、拥有黑色角的宝可梦出现，释放出黑色的波动能量，直接命中了受伤的毒刺水母，毒刺水母失去战斗能力，被髅队成员收回精灵球。
“可恶！”另一名髅队成员气急败坏，“刺甲贝，使用破壳！巨牙鲨，水流裂破！”刺甲贝的外壳裂开，攻击力和速度大幅提升，再次喷出冰锥；巨牙鲨则包裹着水流，向着红色暴鲤龙再次发起冲击。
“暴鲤龙，龙舞！”星海的指令简洁而精准。红色暴鲤龙的身体周围泛起红色的光晕，速度和攻击力迅速提升，它灵活地避开了冰锥和水流裂破，然后猛地转身，用坚硬的头部撞击在巨牙鲨的身上。巨牙鲨发出一声惨叫，失去了战斗能力。
“刺甲贝，快使用潮旋！”最后一名髅队成员试图顽抗。刺甲贝旋转起来，形成一个巨大的旋涡，想要将众人卷入其中。
“西狮海壬，使用泡沫光线！”水莲及时发起攻击。西狮海壬喷出大量的泡沫，泡沫在漩涡中爆炸，破坏了漩涡的结构。小智紧接着喊道：“皮卡丘，铁尾！”皮卡丘的尾巴变得坚硬如铁，猛地抽打在刺甲贝的外壳上，刺甲贝彻底失去了战斗能力。
三名髅队成员见势不妙，想要趁机逃跑。“想跑？没那么容易！”默丹眼中闪过一丝寒光，“阿勃梭鲁，使用追打！”阿勃梭鲁的速度极快，瞬间追上了逃跑的髅队成员，将他们拦住。星海拿出通讯器，联系了库库伊博士：“库库伊博士，我们在波尼湾深海发现髅队成员，已经制服了他们，麻烦你通知国际刑警来处理。”
“收到，星海！我马上联系！”通讯器那头传来库库伊博士的声音。
解决了髅队成员后，众人继续向着深海前进。很快，一个巨大的黑色装置出现在众人眼前——这个装置被固定在海底的礁石上，周围连接着许多管道，正在不断吸收着海水的能量，同时释放出黑色的污染物质。装置的周围，还有几只被控制的水系宝可梦在守卫，包括一只巨大的盖欧卡玩偶？不，仔细一看，是一只被黑暗能量影响的吼鲸王。
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