人产生“仓库空无一物”的错觉。李卫将中和剂撒向屏障，光晕瞬间消散，露出里面堆积如山的药材。守卫的药纹使见状，手持星纹药杵冲了出来。李卫带领衙役展开激战，陈默启动能量干扰仪，药纹使的星纹武器失效，很快被制服。
落马坡方向，石三也成功解救了西域商队。商队首领“阿不力孜”感激道：“多谢大人相救！劫匪抢走了我们一半的药材，说要运到‘西山废弃药庐’！”石三立刻带领精锐赶往西山，在废弃药庐中抓获了劫匪，追回了被劫药材。药庐内还发现了大量药纹石和星纹药材加工设备——正是药纹使的秘密据点。
太医院内，春柳和沈若薇根据《本草纲目》和星纹药材特性，研制出替代药方：用紫苏叶代替麻黄，生姜代替桂枝，配上甘草、杏仁，虽疗效稍慢，但能有效缓解风寒症状。刘阳明让人将药方誊抄数百份，张贴在京城各街巷，并组织靖安司和太医院的人手，在全城设立“免费施药点”，疫情得到初步控制。
十二月十八，囤积和被劫的药材陆续运抵太医院。陈默用中和剂处理后，药材恢复正常。康熙得知消息，龙颜大悦：“阳明，你又一次解了京城之危！这些药纹使真是可恶，竟敢拿百姓性命做文章！”刘阳明躬身道：“皇上，臣在西山废弃药庐搜出了药纹使的《药纹秘册》，上面记载着他们的计划——先用药材短缺加剧疫情，再用‘药纹特效药’控制朝廷官员，最后配合其他异世残余打开主裂隙！”
康熙脸色一沉：“看来异世残余还在蠢蠢欲动。阳明，你继续追查药纹使的残余势力，务必将他们彻底铲除！另外，传旨下去，重赏西域商队和配合调查的药材商，对囤积居奇的同德堂等三家药材商，没收囤积药材，处以罚款，以示惩戒。”刘阳明领旨：“臣遵旨！”
接下来几日，刘阳明带领团队追查药纹使残余。陈默根据《药纹秘册》中的能量频率，调整监测仪，很快锁定了三名隐藏在太医院的药纹使卧底。十二月二十，三人被成功抓获，审讯后得知药纹使总坛在“西南苗疆”的“药王谷”，坛主“药尊”擅长用星纹炼制“控制药剂”，能让人失去意识，听从指令。
“控制药剂！”刘阳明心中一凛，“若这种药剂流入京城，后果不堪设想！我们必须立刻前往苗疆，摧毁药王谷！”康熙得知后，立刻下令：“阳明，朕命你带领靖安司精锐，即刻前往苗疆！朕已传旨湖广总督，让他派军队协助你！”刘阳明躬身领命：“臣遵旨！”
十二月二十二清晨，队伍启程前往苗疆。沈若薇因熟悉药材特性，主动请缨同行：“我能识别药纹药材和控制药剂的成分，或许能帮上忙。”刘阳明点头同意。队伍行驶在西南的山道上，陈默拿着监测仪，神色凝重：“大人，监测到药王谷方向有强烈的药纹能量波动，他们可能在炼制新的控制药剂！”
一月初五，队伍抵达苗疆边境，与湖广总督派来的军队汇合。药王谷坐落在群山深处，谷口布满了毒瘴和药纹陷阱。沈若薇辨认出毒瘴是由“迷魂草”和“瘴气菌”混合而成，用艾草和雄黄能驱散。刘阳明下令：“士兵们佩戴艾草雄黄香囊，陈默带领技术官破解药纹陷阱；李卫、石三带领精锐从谷两侧的悬崖攀爬，绕到谷后；我带领春柳、沈若薇从正面进攻，吸引药纹使的注意力。”
行动开始，正面进攻的队伍刚到谷口，便遭遇药纹使的袭击。他们甩出带有药纹能量的毒针，幸好沈若薇早有准备，让众人穿着浸过“解毒草汁”的衣物，毒针无法穿透。陈默则用能量干扰仪破解了谷口的药纹陷阱，李卫和石三带领精锐从谷后突袭，药纹使腹背受敌，很快溃不成军。
药王谷内，药尊正在炼制控制药剂。看到队伍冲进来，他怒吼一声，挥动药杵释放药纹能量波。沈若薇甩出提前配制的“药纹中和粉”，能量波瞬间减弱。刘阳明冲上前，一剑刺穿药尊的肩膀：“你的阴谋结束了！”药尊想要引爆药剂炉，被春柳甩出的麻痹散箭射中，当场倒地。
战斗结束后，众人摧毁了药剂炉和药纹装置，解救了被药纹使控制的苗疆百姓。在药王谷的密
