延断后，姜维次之；如果魏延不服从命令，大军就自行出发。诸葛亮去世后，杨仪秘不发丧，让费祎去试探魏延的意向。魏延说：“丞相虽死，我魏延还在。丞相府的亲信官属，可将灵柩送回安葬，我自当率各军进攻敌人；怎么能因一人之死而废弃天下大事呢！况且我魏延是什么人，岂能被杨仪约束，做断后的将领！”于是自己与费祎共同部署行留安排，让费祎亲笔书写与自己联名，传告诸将。费祎骗魏延说：“我当为您回去向杨长史解释。杨长史是文官，很少经历军事，必定不会违抗您的命令。”费祎出营门后，策马飞奔而去。魏延随即后悔，但已追不上了。
魏延派人探看杨仪动静，得知杨仪等准备按诸葛亮既定部署，各营依次领军撤退。魏延大怒，抢在杨仪出发前，率领所属部队径直南归，沿途烧毁所过栈道。魏延、杨仪各自上表指控对方叛逆，一天之内，告急文书交相传递到成都。后主刘禅询问侍中董允、留府长史蒋琬，蒋琬、董允都担保杨仪而怀疑魏延。杨仪等命士兵砍伐山林开辟通道，昼夜兼行，也跟在魏延之后。魏延先到，占据南谷口（今陕西汉中北），派兵迎击杨仪等。杨仪等命将军何平（王平）在前抵御魏延。何平斥责魏延的先头部队说：“丞相刚死，尸骨未寒，你们怎敢如此！”魏延的士兵知道魏延理亏，不肯为他卖命，都溃散了。魏延只带着几个儿子逃亡，奔向汉中。杨仪派将领马岱追上斩杀了他，并诛灭魏延三族。蒋琬率宿卫各营北上处理危难，走了几十里，传来魏延的死讯，于是返回。当初，魏延想杀杨仪等，希望舆论推举自己代替诸葛亮辅政，所以不向北投降魏国而南归攻击杨仪，实际并无反叛之意。各军返回成都，大赦天下，追谥诸葛亮为忠武侯。当初，诸葛亮曾向后主上表说：“我在成都有桑树八百株，薄田十五顷，子弟的衣食已很宽裕。我不经营别的产业来增加收入。我死之日，不让家中有多余的布帛，外面有多余的财产，以免辜负陛下。”最终果然如此。丞相长史张裔常称赞诸葛亮说：“丞相赏赐不遗漏疏远的人，惩罚不偏袒亲近的人，官爵不能无功获取，刑罚不能因权贵豁免，这就是贤愚都能忘身报国的原因啊！”
陈寿评论说：诸葛亮担任丞相，安抚百姓，明示礼仪法度，精简官职，依从权宜之制，开诚布公；对尽忠有益国家者，即使是仇人也必加赏赐；对违法失职者，即使是亲信也必予惩罚；对认罪悔改者，即使罪重也必从宽释放；对巧言掩饰罪过者，即使罪轻也必严惩；再小的善行也无不奖赏，再小的恶行也无不贬责；处理事务精明干练，凡事抓住根本，依据名义要求实效，极端厌恶虚伪。终于使蜀国境内的人都敬畏爱戴他，刑罚政令虽然严厉却无人怨恨，是因为他用心公平而劝戒分明。他可说是懂得治国之道的杰出人才，能与管仲、萧何相媲美了！
当初，长水校尉廖立，自认为才能名声应做诸葛亮的副手，常因职位清闲而怏怏不乐，不断抱怨诽谤。诸葛亮将廖立废为平民，流放到汶山（今四川汶川）。诸葛亮去世后，廖立流泪说：“我终究要成为异族（指永无出头之日）了！”李平（李严）听说后，也发病而死。李平常盼望诸葛亮能重新起用自己，得以弥补过失、官复原职，估计后人不会这样做的缘故。
习凿齿评论说：从前管仲没收伯氏骈邑三百户，伯氏至死无怨言，圣人（孔子）认为很难。诸葛亮使廖立垂泣，李平（李严）致死，岂止是没有怨言而已！水极平，邪恶者也会取法；镜极明，丑陋者也会忘记发怒。水和镜之所以能穷尽物象而不招怨谤，是因为它们无私。水和镜无私，尚且能免遭诽谤，何况大人君子胸怀乐生之心，流布怜悯宽恕的恩德，执法于不可不罚之时，刑罚加于自犯之罪，授爵不偏私，诛杀不迁怒，天下还有不心服的人吗！
蜀地百姓纷纷请求为诸葛亮建立祭庙，后主刘禅不准。百姓于是在道路旁和田野上逢节祭祀。步兵校尉习隆等上书说：“请在靠近其墓地（定军山）的沔阳（今陕西勉县），建立一座祭庙，禁止民间私祭。”后主同意了。
后主任命左将军吴懿为车骑将军，授予符节，督守
