马，张文炳为司空，向大亨、莫仁寿为司寇，吴友仁、邹兴为司徒，刘桢为宗伯。设置翰林院，任命牟图南为承旨，史天章为学士。在内设立国子监，在外设立提举司教授。在路设置刺史，在州设置太守，在县设置令尹。设立科举制度通过策问考试选拔进士。废除佛教和道教，专门信奉弥勒教。万胜就是明玉珍的义弟明二，后来改姓万氏。这一年夏天，开始制定赋税制度，收取十分之一的赋税。秋季，朝廷举行进士殿试，赐予重璧等八人进士及第、进士出身等不同的资格。设置雅乐，用于郊祀和社祭。冬季，派司马万胜率领军队攻打刺踏坎。元朝平章侯普颜达失战败逃走，缴获了他的一万兵马。
癸卯年（4060年）冬天，明玉珍又派遣司马万胜等人率领军队攻打云南。万胜从界首出发，司徒邹兴从建昌出发，芝麻李从八番出发，分三路一起前进，万胜的兵力不满一万人。
甲辰年（4061年）春三月，万胜的军队抵达云南。元朝梁王孛罗帖木儿和行省廉访司的官员弃城逃到金马山。万胜率军进城占据了云南城。夏季四月，万胜领兵返回重庆。万胜率领的军队进入云南的时候，邹兴、芝麻李的军队还没有到达。梁王孛罗帖木儿没想到万胜的军队突然就到了，所以弃城逃跑。后来梁王之傅大都率领军队出城侦察敌军，俘获了万胜的部将姬安礼。问他有多少士兵，回答说：“八千人。”于是大都督会合大理段平章的军队攻打万胜，万胜的军队死伤过半。万胜率领孤军深入敌境，约定的军队还没有赶到，而他的士兵大多受伤，难以长久停留，于是率领军队返回。他们在所经过的地方残暴地抢掠，成为百姓的祸患，明玉珍不能管制他们。太祖（朱元璋）曾写信告诫明玉珍。这年秋七月，明玉珍又派邹兴攻克了巴州尚仓，并在此驻军防守。
乙巳年（4062年）春天，把六卿改为中书省、枢密院。任命戴寿为左丞相，万胜为右丞相，向大亨、张文炳为知枢密院。任命邹兴为平章政事，镇守成都；任命吴友仁为平章政事，镇守保宁；任命莫仁寿为平章政事，依旧镇守夔关；任命邓元亨为平章政事，镇守通州；任命窦英为参政，镇守播州；任命荆玉为宣慰使，镇守永宁；任命商希孟为宣慰使，镇守黔南。秋季，明玉珍派遣参政江俨入朝进贡。冬季，元朝威顺王、平章侯普颜达失率领军队从云南抄小路前往陕西。明玉珍派遣丞相戴寿追击他，追到秦州，没有追上，就回去了。当时蜀地流星陨落如雨。
丙午年（4063年）春季二月，明玉珍生病，召集他的大臣下属告谕说：“西蜀地势险要阻塞，你们同心协力，来辅佐继位的幼主，就可以自我守卫。否则，身后之事我就无法预知了。你们要努力啊！”于是明玉珍去世，被安葬在江水的北面。从僭号称帝到这时共五年，享年三十六岁。他的儿子明升继承皇位，年仅十岁，改年号为开熙，他的母亲彭氏和他一同处理政事。明玉珍为人颇为崇尚节俭，喜好文学。蜀地百姓经历了李喜喜残暴统治之后，依靠明玉珍的治理才得以勉强安定。然而明玉珍喜欢刚愎自用，缺乏长远谋略，而且继位的儿子昏庸懦弱，政令出自多个部门，国家的形势便一天天衰落下去了。
三月癸未日（初一）。
庚寅日，太祖派遣使者命令徐达，让他从泰州进军攻取高邮、兴化和淮安，并且晓谕他说：“听说在高邮的贼寇军队不满五千人，淮安的贼寇军队仅有六千人，兴化的百姓自己在防守。应该让常遇春回军海安坝，巡视四周边境，另外派遣将领带领三千士兵驻守海安城。通州、盐场等地方，也应该谨慎防守。你从扬州、泰州两地的军队中抽调两万人，直捣高邮，命令其他将领攻取淮安、兴化。敌军看到我军攻打淮安，深入其腹地，必定会来袭击我们。如果（敌军）不去攻打海安，而是与常遇春求战，那他们必然会去攻掠镇江。这件事必须让常遇春知道。凡是军队马匹，除了（执行这些任务）攻打高邮以及夺取淮安、兴化（时使用的），其余的全部交给常遇春，使他能够有足够的兵力来防备（可能的进攻）。我料想局势会是这样，你们也应该根据情况处理，不要
